Tagged: HPC

Building Gaussian 09 with Intel compiler and MKL

Building Gaussian 09 with Intel compiler and MKL

OK, my previous attempt on g03 has failed. So I try to work on g09 instead.Building of Gaussian with Intel...

infiniband 환경에서 HP-MPI 사용 Solver의 통신방식을 강제로 TCP 로 지정하기

infiniband 환경에서 HP-MPI 사용 Solver의 통신방식을 강제로 TCP 로 지정하기

On some Linux machines, Infiniband libraries are installed (for example with OpenMPI) without the corresponding kernel drivers and/or hardware. This...

Intel OpenMP 사용법

1. Intel Fortran Compiler 설치 2. /opt/intel/Compiler/11.1/073/bin/intel64 에서 ifortvars_intel64.csh, ifortvars_intel64.sh 파일을 /etc/profile.d/ 에 복사하면 환경설정 파일이 loading된다.( OS버전이 x86일 경우에는...

RHEL6기반 Freesurfer & FSL & Connectome Mapper 환경 구축하기

RHEL6기반 Freesurfer & FSL & Connectome Mapper 환경 구축하기

Freesurfer & FSL & Connectome Mapper 설치 환경 구성하기 작성자 : 서진우 작성일 : 2012년 5월 28일   1. 시스템...

Parallel Jobs and SGE Parallel

Parallel Jobs and SGE Parallel

1. Parallel Jobs and SGE Parallel Environments When a parallel job starts running under any batch system, a mechanism must...

sge 환경에서 openmpi 테스트 하기

sge 환경에서 openmpi 테스트 하기

# /opt/openmpi/bin/mpicc mpi_test.c -o mpi_test————————————————————————————— ############### #  mpi_test.c # ############### #include “mpi.h” #include <stdio.h> int main (int argc, char *argv[])...

Gromacs  MPI 설치하기

Gromacs MPI 설치하기

설치 환경  ● OS : OpenSuse 11.2  ● Arch : x86_64  ● 설치경로 : /opt gcc 업데이트, OpenMPI 설치하기클러스터에 병렬연산을 하기...

intel compiler 최적화 병렬 옵션

intel compiler 최적화 병렬 옵션

인텔 컴파일러에 최적화 옵션 중 하나인 -parallel 옵션을 사용하면 시스템에서 보유한 processor를 이용하여 자동으로 코드를 병렬 처리시켜준다. 이때 기본적으로 시스템이...

SGE Tuning guide

SGE Tuning guide

발췌 : http://arc.liv.ac.uk/SGE/howto/tuning.html Tuning guide Grid Engine is a full function, general purpose Distributed Resource Management (DRM) tool. The scheduler...